(一)DNA片段的回收与连接
在本实验中,目的DNA片段的回收采用的是北京鼎国生物技术发展中心的DNA回收/纯化试剂盒(表4-1)。
表4-1 DNA回收试剂盒的组成
| 名称 |
剂量 |
试剂组成/说明 |
溶液A |
100mL |
6mol/L NaClO4,0.03mol/L NaAc(pH5.2),少量酚红 |
溶液B |
1.5mL |
3mol/L NaAc |
溶液C |
60mL |
用时需要加入70mL无水乙醇,充分混匀 |
溶液D |
6mL |
TE缓冲液 |
DNA片段回收方法如下:
(1)切取含DNA片段的琼脂糖(100mg-300mg),用吸头捣碎,按重量比1:3(切取重量与溶液的A体积比)加入溶液A;
(2)50-65℃水浴5-10min,待凝胶全部溶化,其间振荡助溶2-3次,加入15μL溶液B,充分混匀;
(3)将溶液置于离心柱中,静止2min,10000rpm离心30s,若一次加不完,可分两次离心;
(4)倒掉液体,加500μL溶液C于离心柱中,10000rpm离心30s,弃液体;
(5)重复步骤(4)一次;
(6)12000rpm离心1min,甩干剩余液体,除去残余的酒精;
(7)将离心柱放置于新的离心管中,室温敞开离心管盖,放置10min,使乙醇挥发殆尽;
(8)加入20μL溶液D(50℃水浴),静止2min;
(9)15000rpm离心1min,管底溶液即为所需的DNA;
(10)将DNA储存于贮存于-20℃冰箱中。
(11)按照表4-2配制连接溶液,16℃连接过夜。
表4-2 目的片段与pMD 18 T-vector连接反应体系
| 反应组分 |
用量 |
Ligation solution I |
5μL |
cspA1/cspA2/cspA3 |
4μL |
pMD 18 T-vector |
1μL |
|
Total 10μL |
(二)大肠杆菌感受态细胞的制备
(1)大肠杆菌DH5α、BL21(DE3)的甘油菌按1:100接于3mL的LB液体培养基的试管中,37℃摇床培养过夜;
(2)取1mL菌液转接到100mL的LB液体培养基的锥形瓶中,37℃震荡培养1-2h;
(3)将菌体转移到50mL的已灭菌的冰预冷的离心管中,冰上放置10min;
(4)4000rpm,4℃离心10min,收集菌体细胞;
(5)倒掉培养液,将离心管倒置1min,以便培养液彻底流尽;
(6)用冰预冷的0.1mol/L caCl2溶液10mL悬浮沉淀细胞,冰浴30min;
(7)4000rpm低温离心10min,收集菌体细胞;
(8)用冰预冷的0.1mol/L caCl2溶液2mL悬浮沉淀细胞,置于冰上;
(9)分装细胞,每100μL装于一个微量离心管中;
(10)每个100μL细胞中加入等量40%甘油溶液,混匀,-70℃保存。
(三)重组子转化大肠杆菌
制备含抗生素的蓝白斑筛选琼脂平板:
(1)将刚灭完菌的LB固体培养基待冷却到60℃左右,加入抗生素、混匀,倒入培养皿中;
(2)待培养基凝固后,在琼脂平板上加入40μL的20mg/mL的X-gal和4μL的200mg/mL IPTG溶液,用涂布器涂匀;
(3)避光保存3h,以利于IPTG和X-gal的吸收。
重组子的转化主要步骤:
(1)取200μL甘油保存的感受态细胞,低温融化后,加入5μL重组质粒,混匀,冰上放置30min;同时做两个对照,即200μL感受态细胞、不加任何质粒DNA和200μL感受态细胞、加入不带外源DNA的空载体;
(2)将转化的混合物立即放入42℃循环水浴中90s,不要晃动;
(3)冰浴2min;
(4)在转化子中加入600μL不含抗生素的LB液体培养基,37℃摇床培养1h;
(5)5000rpm离心5min,沉淀细菌细胞;
(6)吸弃约500μL上清液,将沉淀与剩余的上清混匀,分为100μL和200μL分别涂在制备好的含Amp的琼脂平板上,阴性对照的转化混合物,一部分涂于含Amp的琼脂平板,一部分涂于不含Amp琼脂平板上,检测感受态细胞是否污染;
(7)待菌液完全被吸收后,37℃倒置培养12-16h。
(四)重组质粒的酶切鉴定
挑取琼脂培养板上的“白斑”单菌落,移至3mL LB(Amp+)液体培养基中,37℃剧烈摇荡培养过夜,应用实验三方法提取质粒pMD 18 T-cspA1、pMD 18 T-cspA2以及pMD 18 T-cspA3,电泳鉴定。
选用Bgl II/Kpn I双酶切鉴定pMD 18 T-cspA1、pMD 18 T-cspA2以及pMD 18 T-cspA3质粒连接方向。先将pMD 18 T-cspA、Kpn I、10×L buffer以及dH2O混合(表4-3),37℃保温3h后,用冰预冷的无水乙醇-20℃沉淀DNA 30min,15000rpm高速离心,70%乙醇洗涤;在加入Bgl II、10×H buffer以及dH2O进行第二步酶切。加入10×loading buffer后进行琼脂糖凝胶电泳。
表4-3 连接方向鉴定反应体系
| 反应组分 |
用量 |
pMD 18 T-cspA |
3μL |
Kpn I |
1μL |
10×L buffer |
2μL |
dH2O |
up to 20μL |
10×H buffer |
2μL |
Bgl II |
1μL |
dH2O |
up to 20μL |
示例一: |